การดูแลโรคที่ดีที่สุดคือการป้องกันทำได้ดังนี้
1. ห้ามขยายพันธุ์จากต้นที่เป็นโรคนี้ และต้องระมัดระวังการนำกิ่งพันธุ์จากที่อื่นเข้าไปปลูกปะปนเนื่องจากมะนาว อ่อนแอต่อโรคนี้ได้ง่าย
2. ควรปลูกไม้บังลมรอบสวนเพื่อลดการเกิดแผลจากการเสียดสีของกิ่งมะนาวโดยลม เพราะเชื้อเเบคทีเรียสาเหตุของโรคนี้จะเข้าทางบาดแผลได้ง่าย
3. ให้เก็บมะนาวที่เป็นโรคและหล่นอยู่บริเวณใต้ต้นมะนาวออกเสียก่อน เพราะเมื่อเกษตรกรรดน้ำ เชื้อจะไปอยู่ในดินได้ข้ามปี และต้นมะนาวจะดูดน้ำที่มีเชื้อโรคแคงเกอร์ขึ้นมาใช้อีก หลักจากนั้น ให้ตัดกิ่งมะนาวที่เป็นโรคแคงเกอร์นำออกไปเผาทำลายนอกสวนมะนาวเพื่อป้องกัน เชื้อโรคแพร่กระจาย
4. ป้องกันเเมลงกัดหรือทำลายใบโดยเฉพาะหนอนชอนใบ เพราะรอยแผลจะเป็นช่องทางให้เชื้อแบคทีเรียสาเหตุของโรคเขาทำลายซ้ำเติมรุนแรงยิ่งขึ้น
5. ควรใช้สารประกอบทองแดง เช่น คอปเปอร์ออกซีคลอไรด์ คอปเปอร์ออกไซด์ อัตรา 30-50 กรัมต่อน้ำ 20 ลิตร หรือสารคอปเปอร์ไฮดอกไซด์ อัตรา 10-12กรัมต่อน้ำ 20 ลิตร ฉีดป้องกันก่อนฤดูฝน หรือเกิดโรคเพียงอาการเริ่มแรก ทุกๆ 7-10 วัน โดยเฉพาะในระยะใบอ่อนจนพ้นระยะการเจริญเติบโต